O Supremo Tribunal da Assinatura Apostólica manteve-se por mercê de Deus e desta Sé procurando dirimir questões que afligiam o clero. Grandes homens escolhidos e preparados foram incumbidos de dar forma a esta missão que ainda hoje se perpetua. Abaixo segue-se a lista documentada de prefeitos do Supremo Tribunal da Assinatura Apostólica a partir do pontificado de Paulo II.
- Dom Evaldo Cardeal Júnior;
- Dom Victor Gabriel Cardeal Santos;
- Dom Dauaan Cardeal Oliveria;
- Dom Júlio Ângelo Cardeal Médici;
- Dom Tiago Cardeal Pina
- Dom Samuel Henrique - Em vigência.
